工程师很容易理解DNA技术
说实话,笔者对生物学曾经不以为然。说来惭愧,可能因为笔者在高中的时候没学好孟德尔定律,由此认定生物学是一门非常复杂、需要死记硬背的科目。笔者的专业是物理学及其应用,而不知为什么日本的生物学家中有不少人否定还原论,以及通过研究和实验增长知识的科学观,这也是笔者抵触生物学的原因。
不过,国外有几项生物技术,尤其是与DNA相关的研究,却跟物理学和工学研究非常相似。笔者在学生时代读过的、由发现DNA构造的沃森(J.D.Watson)编著的《双螺旋》是非常有趣的一本书。这既是一本非常棒的研究笔记,又能让外行像读最好的推理小说一样津津有味地阅读,可以体验到研究的惊险和兴奋。笔者完全没有感觉到物理学、工程学与生物学的隔阂。
为撰写报道,笔者大致了解了一些DNA的相关研究成果。通过学习,笔者还认识到DNA及其作用其实就是将“生命的设计信息”翻译成蛋白质合成的一种信息通信技术。DNA也有相当于通信编码和纠错技术的机制。DNA分析技术则跟现有的通信技术相似。比如,首先放大微弱的信号,然后进行分析。
进步神速超过超级计算机
DNA分析技术的进步史也跟计算机和半导体技术非常相似。比如,分析技术大幅提高了速度。解读人类DNA中的30亿个碱基对序列的“DNA测序”在1990年代之前大部分采用人海战术。笔者有个从事DNA研究的大学同学就经常抱怨连睡觉的时间都没有。
而到了2000年代以后,分析程序的自动化和并行化迅速发展,“分析速度2年提高了大约10倍”。那么10年就提高10万倍。半导体技术在1年半~2年内集成度和工作性能提高到了原来的2倍,超级计算机的速度2年提高了约4倍,10年提高了约1000倍,由此可见DNA分析技术的进步有多快。在1990年代,解读人类DNA所有碱基对需要几年时间,而现在只需1~2天即可完成。
“实验室”内的微细化跟半导体一样
不过,直到几年前,DNA分析技术大多还是化学方法。化学的检查技术不断“微细化”,过去晃动试管的工作已逐渐被整个实验室建立在芯片上的“芯片实验室(Lab-on-a-chip)”技术所取代,并且还推动了DNA分析技术的巨大进步。但是,即使解读时间缩短,所使用的光分析装置的小型化速度却没有能象分析时间那样缩短得那么快。到现在,主要的分析装置大多还有大衣柜那么大,能放到放在桌子上的仪器已算是非常小的了。
最近,电子技术终于走进生物学领域,打破了以往的装置常识,大幅减小了产品尺寸并提高了精度。比如,2012年英国OxfordNanoporeTechnologies公司推出的DNA分析装置跟U盘差不多大,可拿在手里。
电子技术的参与是在化学技术的小型化之后才实现的。虽然晃动试管的工作与电子技术没有联系,但芯片实验室技术可以自然地理解为该工作要依托半导体芯片。顺便一提,流感病毒直径大约为100nm,刚好跟10年前的半导体设计规则差不多。